Phase 1 · 2008–2012
アイアンマンからアベンジャーズ結成まで。MCUの始まり。
億万長者で発明家の軍需産業会社社長トニー・スタークは、視察に訪れた軍のキャンプでテロリストの奇襲に遭い、胸を負傷してしまう。やがて自分の会社の兵器がテロリストに悪用されている衝撃の事実を知ったトニーは、自ら戦闘用のスーツを作り、「アイアンマン」となってテロリストに闘いを挑む。
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科学者のブルース・バナーは、実験中の事故で多量のガンマ線を浴び、怒りで心拍数が上昇すると巨大な緑色のモンスター「ハルク」に変身する体質になってしまう。軍の追跡を逃れながら治療薬の開発に挑むブルースだったが、やがて最強の敵が立ちはだかる。
パワード・スーツの国家への受け渡しを拒否したトニー・スターク。ある日、アイアンマンと互角のパワーを持つ敵ウィップラッシュが現れ、トニーは再びアイアンマンとして立ち上がる。
神の世界最強の戦士とされながら傲慢な性格が災いし地球へ追放されたソー。神の力を失ったソーに凶悪な敵が次々と襲いかかり、彼は地球でも戦いの日々を送ることになる。
第二次世界大戦中、愛国心に燃えるスティーブ・ロジャースはスーパーソルジャー計画で超人的な力を手に入れ、キャプテン・アメリカとして誕生する。ヒドラの陰謀を阻止すべく戦うが、最終的に自らを犠牲にして氷海に沈む。
人知を超えた悪によって進められる地球壊滅の陰謀を食い止めるべく、アイアンマン・ソー・ハルク・キャプテン・アメリカらを集めたチーム「アベンジャーズ」が結成される。しかし各々の過去や苦悩が衝突し合い、チームとしての機能が消失しかけていた。